废水基流行病学: Sewage Surveillance to Track COVID-19
废水的流行病学（WBE）或下水道监测，是对废水的分析，以确定生物或化学品的存在，以监测公共卫生。WBE先前已被用于检测药物或工业废物，药物，病毒和抗生素细菌潜在出现的存在。最近的研究表明，检测废水中的SARS-COV-2冠状病毒可以是跟踪Covid-19爆发的低成本解决方案。
想了解有关下水道水中病毒RNA的浓度，提取和检测方法的更多信息吗？我们在这里提供帮助！
在废水中检测SARS-COV-2：Covid-19的预警系统
该earliest report of wastewater surveillance to track COVID-19 was a study by the KWR Water Research Institute in March 2020. They found the presence of SARS-CoV-2 RNA in wastewater samples in the Netherlands. The report came within a week after the first case of COVID-19 in the country was confirmed. Since then, there have been numerous examples of using WBE to track COVID-19.
虽然WBE无法识别哪些人被感染，但与患者测试相比有几个优点。
废水监测的优点
Early Warning
SARS-CoV-2 RNA can be detected in human feces a few days to a week before the onset of symptoms. Astudyshowed that sewage surveillance can predict COVID-19 outbreaks even before individual patient testing and hospital admissions.
Population-Wide Data
一个废水样品可以提供数千人的平均感染率的数据。这种聚合数据可能对具有低临床Covid-19测试速率的区域尤其提供信息。
低成本
而不是单独测试数千名患者，收集和测试少数废水样本对于获得人口范围的数据来说更具成本效益。
趋势工具
污水的持续监测可用于建立当前爆发的趋势，识别新爆发和感染患病率。
废水中的病毒检测：爆发预防的未来
目前，我们对传染病爆发的反应取决于疫情已经发生后的疾病。通过在下水道水中不断监测病毒，我们可以积极主动地在发生之前识别潜在的爆发。
在废水中检测冠状病毒RNA的方案
- Sample Collection
污水中的病毒检测开始通过在下水道中收集废水样品，其中水排入污水系统的单一点。
- 巴氏杀菌
该collected wastewater samples are pasteurized at 60°C to inactivate any live pathogens.
- 病毒浓度
该virus is concentrated using either aPolyethylene Glycol 8000沉淀，离心过滤或超速离心方法。
- RNA Extraction
提取方法（手动，automated要么high throughput）用于从浓缩的病毒材料中纯化病毒RNA。
- RNA Quantification
量化RNA以确保输入RNA的适当量和质量用于下游分析。
- RT-QPCR扩增
RNA逆转录到cDNA，并通过定量PCR使用用于核衣壳基因（N1 / N2）或包络基因（E）的底漆。我们提供方便SARS-COV-2 RT-QPCR套件专门用于废水。
- 数据分析
该results are analyzed and compared with ongoing levels of viral load within the areas of collection.
新！SARS-COV-2 RT-QPCR套件用于废水
查看废水样品中SARS-COV-2 RNA的详细方案。
通过PEG 8000沉淀制备的废水浓缩物的病毒纯化
通过离心过滤制备的废水浓缩物的病毒纯化
Covid-19的废水测试产品
病毒RNA提取
以下麦克斯韦尔®建议核酸纯化试剂盒从废水样品中提取病毒RNA。这些套件与Maxwell一起使用®仪器允许每次运行最多48个样品的废水中的自动化病毒RNA提取。
We are in the process of developing viral concentration/TNA extraction kits specifically for wastewater samples. For more information, contact us atapplipmation@promega.com.
Purification scale-up and automation support
无论使用的仪表平台如何，我们的实地支持科学家都可以帮助您实现或优化病毒RNA提取方法的自动化。我们将帮助您开发一个满足您特定需求的工作流程！
Viral RNA Quantification
该QuantiFluor®RNA系统含有荧光RNA结合染料，可实现溶液中少量病毒RNA的敏感定量，并优化用于紧凑的双通道Quantus™荧光计。
扩增SARS-COV-2 RNA
PCR试剂包括QPCR和RT-QPCR产品，通常用于检测和扩增靶病毒序列。该SARS-COV-2 RT-QPCR套件用于废水was developed to detect SARS-CoV-2 viral RNA in wastewater and includes multiple controls for internal amplification and inhibitor assessment.
